Bilimsel araştırma projelerine ilişkin hizmetlerin yürütülmesi, izlenmesi, sonuçlarının değerlendirilmesi ile bu süreçlere ilişkin idari ve mali işlemler, 2002 yılına kadar Araştırma Fon Saymanlıkları tarafından yerine getirilmekteydi. Ancak 20.06.2001 tarihli ve 4684 sayılı *“Bazı Kanun ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun”*un 15/e maddesi uyarınca Araştırma Fon Saymanlıkları 01.01.2002 tarihinden itibaren yürürlükten kaldırılmış; bu tarihten itibaren söz konusu görev ve yetkiler Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP) Birimlerine tevdi edilmiştir.
2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu’nun 58 inci maddesinin (b) fıkrasının son bendinde; bilimsel araştırma projelerinin seçilmesine, uygulanmasına ve izlenmesine ilişkin süreçler ile bu projelere tahsis edilecek ödeneklerin kullandırılmasına, genel hükümlerde yer alan ön ödeme sınırlamalarına bağlı olmaksızın avans verilmesine ve bu avansların mahsubuna dair usul ve esasların, Maliye Bakanlığının uygun görüşü alınmak suretiyle Yükseköğretim Kurulu tarafından çıkarılacak bir yönetmelikle düzenleneceği hükme bağlanmıştır. Kanun koyucunun bu düzenlemesi doğrultusunda hazırlanmış olan “Yükseköğretim Kurumları Bilimsel Araştırma Projeleri Hakkında Yönetmelik” 01.01.2002 tarihinde yürürlüğe girmiş olup, bu tarihten itibaren BAP süreçlerine ilişkin hukuki çerçeveyi teşkil etmektedir. Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi ise 07.05.2002 tarihli Cumhuriyet Üniversitesi Senatosu kararı ile teşkil edilerek faaliyetlerine başlamıştır.
Anılan Yönetmeliğin “Tanımlar” başlıklı 3 üncü maddesinde Bilimsel Araştırma Projesi; tamamlanması hâlinde alanında bilime ulusal veya uluslararası ölçekte katkı sağlaması; ülkenin teknolojik, ekonomik, sosyal ve kültürel kalkınmasına hizmet etmesi beklenen; yükseköğretim kurumu içi ve/veya dışı ulusal veya uluslararası kurum ve kuruluşların katılımıyla yürütülebilen bilimsel içerikli çalışmalar olarak tanımlanmıştır. Bu kapsamda, Bilimsel Araştırma Projeleri Birimlerinin temel görevi; ilgili proje tekliflerini değerlendirmek, kabul etmek ve desteklemek, proje uygulamalarını izlemek, rapor ve çıktıları değerlendirmek ve gerekli hâllerde kamuoyu ile paylaşılmasını sağlamaktır.
Bilimsel Araştırma Projeleri Komisyonu kararlarının uygulanmasına yönelik idari ve mali işlemler ile desteklenen projelerin yürütülmesine ilişkin faaliyetleri yerine getiren birimin adı, Yükseköğretim Kurulu’nun 01.01.2009 tarihli “Yükseköğretim Kurumları Bütçelerinde Bilimsel Araştırma Projeleri İçin Tefrik Edilen Ödeneklerin Özel Hesaba Aktarılarak Kullanımı, Muhasebeleştirilmesi ile Özel Hesabın İşleyişine İlişkin Esas ve Usuller” metni ile; ayrıca 26.11.2016 tarihli “Yükseköğretim Kurumları Bilimsel Araştırma Projeleri Hakkında Yönetmelik” hükümleri doğrultusunda Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi olarak güncellenmiştir.